Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA4

AKAP11, A-kinase anchor protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP11Q9UKA4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AKAP11Q9UKA4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP11Q9UKA4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms