Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN4Q9UJW0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN4Q9UJW0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN4Q9UJW0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCTN4Q9UJW0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DCTN4Q9UJW0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms