Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNA9Q9UGM1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms