Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS7AQ9UBW8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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