Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms