Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCIQ9NVI1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms