Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms