Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms