Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPAG4Q9NPE6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms