Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms