Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D2

CEP295, Centrosomal protein of 295 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295Q9C0D2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP295Q9C0D2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP295Q9C0D2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms