Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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