Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM6Q9C030 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM6Q9C030 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms