Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms