Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF4Q9BZC1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF4Q9BZC1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms