Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms