Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HIRIP3Q9BW71 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms