Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
ATG101Q9BSB4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG101Q9BSB4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms