Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms