Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED4Q96RK1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms