Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms