Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.1 ms