Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
YTHDC1Q96MU7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms