Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC138Q96M89 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC138Q96M89 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC138Q96M89 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC138Q96M89 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC138Q96M89 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC138Q96M89 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms