Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms