Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3DQ96BQ1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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