Protein–RNA interactions for Protein: Q92731

ESR2, Estrogen receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR2Q92731 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ESR2Q92731 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms