Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC148Q8NFR7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms