Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms