Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APCDD1LQ8NCL9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APCDD1LQ8NCL9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms