Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPC24Q8NBT2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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