Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB1Q8N987 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms