Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVBPQ8N300 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVBPQ8N300 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms