Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC103Q8IW40 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms