Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT27Q7Z3Y8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT27Q7Z3Y8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms