Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3E2

CCDC186, Coiled-coil domain-containing protein 186, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC186Q7Z3E2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC186Q7Z3E2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC186Q7Z3E2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms