Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSX7Q7RTT5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms