Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBC1D9Q6ZT07 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TBC1D9Q6ZT07 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms