Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00299Q6ZSB3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms