Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC129Q6ZRS4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms