Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM72Q6ZMU5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms