Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHISA2Q6UWI4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SHISA2Q6UWI4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms