Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCD3Q6STE5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms