Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42EP5Q6NZY7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms