Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 RPLP0-202ENST00000313104 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.853e-11■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPLP0-214ENST00000549098 1106 ntTSL 29.71□□□□□ -0.853e-11■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPLP0-205ENST00000546989 993 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.893e-11■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPLP0-209ENST00000547211 781 ntTSL 39.52□□□□□ -0.893e-11■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPLP0-203ENST00000392514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.033e-11■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPLP0-221ENST00000551258 966 ntTSL 58.53□□□□□ -1.043e-11■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPLP0-213ENST00000548568 1127 ntTSL 1 (best)8.39□□□□□ -1.073e-11■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPLP0-210ENST00000547475 792 ntTSL 38.34□□□□□ -1.073e-11■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPLP0-207ENST00000547173 864 ntTSL 37.59□□□□□ -1.193e-11■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.172e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.732e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.452e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.52e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 HNRNPUL1-208ENST00000595196 3043 ntTSL 1 (best)11.81□□□□□ -0.522e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.622e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 HNRNPUL1-213ENST00000599614 2447 ntTSL 510.55□□□□□ -0.722e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.792e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.962e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -12e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.054e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.414e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 NSA2-201ENST00000296802 1199 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.913e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.623e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 NSA2-204ENST00000515524 448 ntTSL 2-0.91□□□□□ -2.553e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 FBL-203ENST00000594309 603 ntTSL 219.37■□□□□ 0.696e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 FBL-211ENST00000601274 877 ntTSL 519.37■□□□□ 0.696e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 FBL-210ENST00000599159 1400 ntTSL 1 (best)19.28■□□□□ 0.686e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 ANKHD1-220ENST00000511151 1216 ntTSL 319.13■□□□□ 0.656e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 FBL-209ENST00000599134 500 ntTSL 518.79■□□□□ 0.66e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 VEGFA-217ENST00000518538 535 ntTSL 218.26■□□□□ 0.516e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 MED15-210ENST00000432052 598 ntTSL 417.99■□□□□ 0.476e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 MED15-225ENST00000477824 571 ntTSL 517.81■□□□□ 0.446e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPL18-211ENST00000550973 1111 ntTSL 517.74■□□□□ 0.434e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.426e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 MED15-215ENST00000444094 551 ntTSL 417.11■□□□□ 0.336e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.334e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 PCNP-207ENST00000498274 786 ntTSL 216.91■□□□□ 0.36e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 FBL-208ENST00000598417 581 ntTSL 516.87■□□□□ 0.296e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 MED15-218ENST00000451058 418 ntTSL 316.77■□□□□ 0.276e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 MED15-205ENST00000414658 717 ntTSL 315.86■□□□□ 0.136e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPL18-201ENST00000084795 612 ntTSL 1 (best)15.62■□□□□ 0.094e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.094e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.094e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.094e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 MED15-206ENST00000420849 430 ntTSL 315.36■□□□□ 0.056e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 MED15-216ENST00000445189 596 ntTSL 415.24■□□□□ 0.036e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 MED15-221ENST00000473028 556 ntTSL 415.24■□□□□ 0.036e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 MED15-207ENST00000423862 581 ntTSL 315.2■□□□□ 0.026e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.016e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 CRKL-202ENST00000411769 2037 ntTSL 1 (best)14.93□□□□□ -0.024e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 MED15-214ENST00000441501 840 ntTSL 314.84□□□□□ -0.036e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 MED15-224ENST00000476767 590 ntTSL 414.84□□□□□ -0.036e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 SKIV2L-209ENST00000483553 1307 ntTSL 514.7□□□□□ -0.066e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPL18-213ENST00000552347 1645 ntTSL 514.38□□□□□ -0.114e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 MED15-219ENST00000457322 623 ntTSL 414.17□□□□□ -0.146e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 MED15-217ENST00000445987 590 ntTSL 414.14□□□□□ -0.156e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 MED15-208ENST00000424287 589 ntTSL 414.1□□□□□ -0.156e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 MED15-228ENST00000487550 587 ntTSL 313.9□□□□□ -0.186e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 SKIV2L-210ENST00000484835 931 ntTSL 213.83□□□□□ -0.196e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPL18-206ENST00000549370 628 ntTSL 513.83□□□□□ -0.194e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPL18-202ENST00000546623 541 ntTSL 513.77□□□□□ -0.214e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 SKIV2L-207ENST00000471818 706 ntTSL 513.74□□□□□ -0.216e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 FBL-207ENST00000597634 726 ntTSL 513.69□□□□□ -0.226e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 AARS-207ENST00000569825 871 ntTSL 213.68□□□□□ -0.226e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 GUK1-216ENST00000464858 633 ntTSL 313.53□□□□□ -0.241e-12■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 ADAMTSL4-205ENST00000483335 1826 ntTSL 1 (best)12.84□□□□□ -0.356e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 FBL-204ENST00000594443 805 ntTSL 312.42□□□□□ -0.426e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPL18-212ENST00000551749 2091 ntTSL 212.23□□□□□ -0.454e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.54e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPL18-216ENST00000552851 691 ntTSL 511.73□□□□□ -0.534e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 VEGFA-216ENST00000512683 475 ntTSL 1 (best)11.48□□□□□ -0.576e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 PCNP-202ENST00000460231 2165 ntTSL 1 (best)11.4□□□□□ -0.596e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPL18-204ENST00000547897 440 ntTSL 511.17□□□□□ -0.624e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPL18-215ENST00000552705 1081 ntTSL 211.03□□□□□ -0.644e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.696e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPL18-210ENST00000550671 764 ntTSL 210.71□□□□□ -0.74e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 SKIV2L-215ENST00000494058 867 ntTSL 210.66□□□□□ -0.76e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.736e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.746e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RSRC2-204ENST00000433877 1956 ntTSL 29.93□□□□□ -0.826e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 PCNP-204ENST00000469941 2028 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.826e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.826e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 AARS-203ENST00000565361 839 ntTSL 59.72□□□□□ -0.856e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.864e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.886e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.896e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RSRC2-220ENST00000532695 2001 ntTSL 29.1□□□□□ -0.956e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 SKIV2L-203ENST00000461915 691 ntTSL 59.05□□□□□ -0.966e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RPL18-203ENST00000547892 3844 nt8.98□□□□□ -0.974e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 SKIV2L-208ENST00000474839 3378 ntTSL 28.83□□□□□ -16e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.016e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 SKIV2L-204ENST00000465703 4507 ntTSL 1 (best)8.54□□□□□ -1.046e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 FBL-205ENST00000595545 896 ntTSL 27.97□□□□□ -1.136e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 SKIV2L-201ENST00000375394 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.166e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.196e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 USP48-207ENST00000471752 445 ntTSL 37.56□□□□□ -1.24e-7■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.236e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 FBL-206ENST00000597224 732 ntTSL 37.23□□□□□ -1.256e-6■□□□□ 8.4
NIPBLQ6KC79 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.256e-6■□□□□ 8.4
Retrieved 100 of 8,528 protein–RNA pairs in 36.9 ms