Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms