Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms