Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3CQ5T2N8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms