Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FGD3Q5JSP0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms