Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00303Q3SY05 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms